Главное отличие этих материалов в их толщине. Микрогофрокартон имеет толщину не более 1,6 мм. тогда как гофра может быть от 2,5 до 5 мм. Толщиной и размером "волны" и обуславливается применение этих картонов.
Микрогофра используется для изготовления товарной упаковки с поклеиванием по ней красочным лайнером. Гофрокартон чаще применяется для транспортной тары, хотя на современную тару тоже принято наносить цветную печать в рекланых целях.